《生化危機》專題特集：最終章、城市毀滅之日

在卡洛斯的協助下，吉兒利用疫苗解除了病毒感染，卻得知政府決定對「浣熊市」實行滅菌作戰。吉兒和卡洛斯一方面應付「Umbrella」派來的內應尼可拉，一方面擊敗了不斷追上來的「追跡者」，在「浣熊市」毀滅前乘坐直升機逃出。另一方面，艾達則在威斯卡的幫助下逃出。市內的生還者與叛變的「Umbrella」亦分批從市內逃離，並帶走「Umbrella」的犯罪證據和病毒疫苗，導致日後「Umbrella」被指控罪行和倒閉。

9月29日至10月1日，生還者躲在一個地下停車場的避難區，喬治在貼滿便條紙的外牆，找到了大學科授好友「彼得」(Peter Jenkins)留下的字條。喬治帶著生還者同伴來到「浣熊市大學」，在彼得的日記找到關於「Umbrella」研究員「格雷格」(Greg Muller)的記錄，凱西背地裡進行疫苗「日之光」(Daylight)的研發，以及把樣本交給彼得。

由於彼得不信任來自「Umbrella」的格雷格，所以彼得把疲於疫苗的配方藏起來，並以暗號留言通知好友喬治，但喬治他們趕到的時候，彼得早就已經死在研究室內。格雷格認為「Umbrella」必須受到制裁，利用他自己開發的「暴君」衍生型「桑納托斯」(thanatos)殲滅進攻大學的U.S.S.。U.B.C.S.的尼可拉使用狙擊槍從遠方發射抑制劑，但抑制失敗令「桑納托斯」失控。

格雷格一方面想制裁「Umbrella」，繼而放任喬治在大學內製作疫苗，同時繼續進行生物兵器的瘋狂研究。格雷格對喬治自白時，被潛伏的尼可拉鎗殺。尼可拉啟動安裝在大學計時炸彈，喬治和生還者一起帶著疫苗離開。爆炸吸引了在直升機上的消防員以及「桑納托斯」注意，生還者們擊倒「桑納托斯」後乘坐直升機撤離「浣熊市」。
(——《Outbreak 決意》完美結局，後續的作品都有提到疫苗「Daylight」。)

另一方面，目擊喪屍疫情爆發的U.S.S成員「羅德里格斯」(Rodriguez)和一部分「Umbrella」研究員決定叛變，協助研究員「琳達」(Linda)回到研究所尋找病毒的解藥「AT1521」樣本，並且遇上躲入研究所大堂的大衛(David King)和其他生還者。為了順利穿過研究所，研究員啟動了一具「暴君」作為護衛，並且在其脖子上安裝炸彈作為保險。

發現炸彈的「暴君」在中途背叛，受到襲擊的琳達與生還者分散，生還者引爆炸彈但未能殺死「暴君」。成功逃回地面的琳達被誤會是喪屍，遭到天橋公路上的U.B.C.S.狙擊，意外地令琳達與生還者會合，並引起了「暴君」的注意。琳達與生還者發現美國政府以「代號XX」核平「浣熊市」，通知羅德里格斯馬上偷走「Umbrella」的貨物先行逃跑，但飛起後受到攻擊令貨物掉落。

掉落的貨物實為「Umbrella」的實驗B.O.W.「夜之女神」(NYX)，「夜之女神」殲滅天橋上的U.B.C.S.，並與生還者展開惡鬥。「夜之女神」吞噬追上來的「暴君」後，生還者利用U.B.C.S.殘留的火箭砲擊殺「夜之女神」，在核彈移平城市前駕駛U.B.C.S.的裝甲車逃出「浣熊市」。包括琳達和羅德里格斯在內，不同地方的生還者在山區公路的休憩區會合。
(——《Outbreak 突破》。關於大批生還者成功逃出「浣熊市」的結局，兩個《Outbreak》的結局中，生還者都帶著解藥、疫苗、犯罪證據成功逃出，造成後續作品量產疫苗和「Umbrella」破產。)

艾達從「NEST」逃出來後，回收了威廉轉化的「G生物」肉體樣本，作為交易籌碼與威斯卡聯絡。威斯卡把「Umbrella」仍然有直升機停在天橋的消息洩露給艾達，而那架直升機是屬於幹部薛爾蓋。艾達穿過有「暴君」出沒的地區登上天橋，偷偷登上直升機垂釣的貨櫃上逃離「浣熊市」。
(——《Darkside Chronicles》詳細描述艾達的逃生經過，時間點與《Outbreak 突破》相同，遭遇的「暴君」也是同一隻。《RE2》改為艾達從生還的U.S.S.幽靈小隊強搶「G病毒」樣本後逃離。)

10月1日凌晨，昏睡兩天的吉兒在教堂內醒來，卡洛斯隻身前往「浣熊市綜合醫院」尋找疫苗。卡洛斯在醫院找到疫苗，同時發現尼可拉殘殺其他生還的隊友，察覺到尼可拉是被「Umbrella」安排進入U.B.C.S.消滅證據的臥底。尼可拉為了滅口在醫院安裝炸彈，卡洛斯趕在炸彈爆炸前逃出，並把疫苗送給在教堂休息的吉兒。康復後的吉兒與卡洛斯得知政府實行滅菌作戰，穿過墓地前往「Umbrella」在「浣熊市」的廢棄處理場(研究所「NEST 2」)。
(——此為原版《BIO3》劇情，在《RE3》廢棄處理場與研究所結合稱為「NEST 2」。《RE3》與這個版本完全不同，時間點改為9月29日，開發疫苗的研究員巴德被尼可拉殺死，醫院只有炸開入口阻擋喪屍進入，「NEST 2」和廢棄處理場設置在醫院的地底。)

吉兒和卡洛斯在「NEST 2」分別受到「追跡者」和尼可拉襲擊，並且在通訊塔確認飛彈已經發射時，遭到尼可拉駕駛的直升機攻擊。最後吉兒負責在廢棄處理場迎擊「追跡者」，卡洛斯則去尋找可以逃離的方法。吉兒利用電磁砲「金手指」在廢物處理場擊敗「追跡者」，並用麥林給了「追跡者」最後一擊。卡洛斯成功聯絡到一架直升機前來救援，意外地機師似乎是吉兒認識的人，吉兒和卡洛斯成功逃出「浣熊市」。
(——此為原版《BIO3》劇情，尼可拉有多重結局，包括被「追跡者」觸手殺死，駕駛直升機被吉兒擊落，或者最後駕駛直升機逃走成功，後續作品有提及尼可拉生還。最後駕駛直升機的機師沒有明確說明，但應該是《BIO1》的貝利‧巴頓。)

卡洛斯和泰瑞爾知道政府打算執行滅菌作戰，打算用「疫苗」與政府交涉，卡洛斯獨自前往醫院地下的研究所「NEST 2」。吉兒醒來後追上卡洛斯的腳步，泰瑞爾在協助吉兒時被「追跡者」殺死。最後吉兒在「NEST 2」成功合成病毒疫苗，但受到「追追跡者」令疫苗被尼可拉搶走。吉兒和卡洛斯合作一度擊敗了「追跡者」，但「追跡者」以最終形態復活。吉兒獨自用電磁砲擊敗「追跡者」，而卡洛斯追著尼可拉前往天台。尼可拉一度打敗卡洛斯以及破壞疫苗，趕上來的吉兒與卡洛斯拉合作開鎗擊傷尼可拉，並搶走尼可拉的直升機成功逃離「浣熊市」。
(——此為《RE3》版本，取消了聯絡救援直升機的部分，也沒有設立分支劇情。雖然遊戲內不能探索天台，但其實有兩台直升機停泊，尼可拉最後也沒有提到生死。)

「浣熊市」事件結束後，琳達和洋子等曾經任職「Umbrella」的研究員接受審訊，與生還者一起指證「Umbrella」的罪利。「Umbrella」因此股價暴跌面臨倒閉，最後據點被克里斯和吉兒組成的「反B.O.W.恐怖災難組織」殲滅，該反恐組織最後改組成為B.S.A.A.。「Umbrella」毀滅一度掀連了與競爭對手「三聯公司」，表面上促使「三聯公司」日後支資助B.S.A.A.，但秘密與威斯卡進行新的B.O.W.研究。
(——《BIO5》及《Umbrella Chronicles》。)

成功逃出「浣熊市」的里昂與美國政府進行交涉，以保護雪莉為條件接受訓練成為總統直屬特工，雪莉在成年後以恢復自由為條件，同樣受訓練成為美國政府特工。克蕾兒加入了民間的反B.O.W.組織，在里昂的幫助下與克里斯重逢，後來多次捲入生化恐怖組織的事件。
(——《BIOHAZARD CODE：Veronica》、《BIO4》。)

本次專題的譯名以目前通用名字或者台灣中文版為主，並在文章首次出現時以引號和英文註釋作識別。